Venne costruita nel XV secolo su di una preesistente fortificazione quando l'abate novarese Barbavara si insediò nell'omonimo paese il 26 ottobre 1426, ed oggi è ancora ben conservata.

In epoca antecedente esistevano sicuramente delle fortificazioni in quanto Mercurino Pace, podestà di Milano, nel 1223 ordinò la distruzione delle fortificazioni di Sannazaro.

Il campanile e le opere del monastero si salvarono in quanto riscattate nel 1248 corrompendo il marchese Manfredi II Lancia.