La Sezione Didattica illustra ai visitatori i principali siti d'interesse storico-archeologico del territorio, le vicende storiche di Pyrgi e del Castello di Santa Severa, i temi specifici del museo inerenti l'antica vita sul mare, la ricerca archeologica subacquea e marittima.
  La sezione comprende plastici ricostruttivi in scala del santuario etrusco, della cittā romana di Pyrgi e del Castello di Santa Severa nel suo aspetto odierno. La parte dedicata al mare comprende modelli di navi da guerra e da trasporto etrusche, greche e romane, la simulazione al vero dell' affioramento di un relitto dal fondale sabbioso con anfore e doli viene proposto al visitatore all'inizio dell'esposizione insieme ad una tipologia di anfore da trasporto etrusche, puniche greche e romane.
La sala, provvista di attrezzature audio-video e di un punto-vendita, č appositamente predisposta per ospitare convegni, conferenze ed altre attivitā culturali.