L'apparato digerente

Le tartarughe sono prive di denti ma possiedono al loro posto una sorta di becco corneo con i bordi taglienti atto a ridurre i cibi in piccoli frammenti prima della deglutazione.
La lingua molle non può essere allungata fuori delle cavità orale.
L'apparato digerente non presenta peculiarità notabili; lo stomaco è generalmente semplice, l'intestino manca di cieco e sfocia nella cloaca tondeggiante il cui sfintere anale si apre alla base della coda.

L'apparato respiratorio

L'apparato respiratorio è polmonare, quindi le tartarughe sfruttano l'ossigeno atmosferico; pertanto, pur avendo notevolissima capacità di apnea, non possono restare per più di un certo tempo sott'acqua e devono portarsi ogni tanto in superficie a prendere delle boccate d'aria .
Alcune specie fanno eccezione alla norma perchè a integrazione dell'apparato respiratorio polmonare posseggono degli organi speciali dal tessuto molto vascolarizzato che consentono loro di sfruttare l'ossigeno dell'acqua; tali organi sono collocati, a seconda delle specie, in prossimità della gola o in due saccheti laterali alla cloaca; nel primo caso l'acqua viene aspirata dalla bocca, nel secondo viene immessa nei "sacchetti" attraverso lo sfintere anale.
La particolare conformaziione della gabbia toracica, dalla muscolatura pressocchè atrofizzata, fa si che l'immissione d'aria nei polmoni e la susseguente espulsione devono essere agevolate, oltre che dall'azione della fascia diaframmatica, anche dal movimento ritmico di distensione e ritrazione di arti e collo.

L'apparato circolatorio

L'apparato circolatorio ha un cuore formato di due artii separati e d'un ventricolo; il seno venoso è annesso all'atrio destro; nel ventricolo, diviso in due da un rilievo incompleto, è compreso il bulbo arterioso.

L'apparato uro-genitale

L'apparato uro-genitale è munito di vescica donde l'urina viene avviata alla cloaca ove hanno pure sbocco le vie genitali. I soggetti maschi posseggono un organo intromittente dentro la cloaca a metà strada circa tra la base e la cima della coda, organo che non serve alla funzione urinaria ma solo a quella riproduttiva. La femmina è provvista di due ovaie piuttosto grandi, ciascuna collegata alla cloaca per mezzo di un ovidutto.

Le tartarughe sono ovipare e tutte le specie, quale che sia il loro habitat, depongono le uova sul terreno lasciando al calore naturale il compito di incubarle.

ORGANI SENSORIALI

Tra gli organi sensoriali, buon sviluppo hanno l'olfatto, il tatto ed anche la vista; manchevole è invece l'udito.
L'occhio è munito di una membrana nittitante e di due palpebre; è anche collegato con una ghiandola lacrimale. Le narici si aprono anteriormente al muso nella parte superiore.
L'apparato auditivo non ha aperture esterne.
Il gusto e l'olfatto sono molto svluppati; Nel loro vagare alla ricerca di cibo, le tartarughe racolgono continuamente particelle odorose, che attraverso le nari e il dotto nasofaringeo giungono all'epitelio olfattivo posto sulle coane; analizzata la provenienza dell'odore, raggiungono il possibile alimento, ma per comprenderne la commestibilità (e qui entrano in gioco le cellule gustative sparse sulla lingua) l'assaggiano ripetutamente. Questo comportamento, con la variante che le particelle odorose giungono alle coane con l'acqua, è ancora più spinto nelle specie acquatiche, che non possono contare molto sulle proprie capacità visive e si devono quindi muovere eslorando a tentoni il fondo, tastando ogni cosa potenzialmente commestibile. Forse per questo nellla dieta delle specie palustri come Emys orbicularis, compaiono in grossa percentuale prede già morte e spesso in decomposizione (senz'altro molto odorose anche in acqua).